Dziesięcioletni Nils Holgersson mieszka z rodzicami w wiosce na południu Szwecji. Chłopiec jest samolubny, rozkapryszony i dręczy zwierzęta. Pewnego dnia, kiedy odmawia wyjścia do kościoła, ojciec nakazuje mu przeczytać fragmenty z Biblii, z których zostanie później odpytany. Nils zostaje sam w domu. Znużony perspektywą czytania Pisma Świętego przeszukuje starą skrzynię, w której znajduje krasnoludka. Chłopiec chce go uwięzić w klatce, za co krasnoludek zmienia go w człowieczka własnego wzrostu. Kiedy chłopiec wychodzi na zewnątrz, zwierzęta które dotychczas były ofiarami jego „zabaw” – teraz usiłują wziąć odwet. Z opresji ratuje go gąsior Marcin, który zabiera go w podróż do Laponii. W trakcie tej niezwykłej podróży Nils poznaje Szwecję i przeżywa rozmaite przygody, a następnie powraca do domu całkowicie odmieniony wewnętrznie i krasnoludek przywraca go do pierwotnych rozmiarów. Film jest adaptacją powieści Selmy Lagerlöf, laureatki nagrody Nobla, jednej z najwybitniejszych postaci skandynawskiej kultury.