Film opowiada historię grupy badaczy, którzy próbują dociec genezy gatunku ludzkiego. Większa część akcji rozgrywa się na pokładzie statku kosmicznego „Prometeusz”, którym bohaterowie podróżują do najmroczniejszych zakątków wszechświata. Bohaterowie muszą odnaleźć się w sytuacjach, których nie przewidzieli, od ich misji zależy przyszłość rasy ludzkiej.

„Prometeusz” jest jak prequel „Obcego” – mówi Ridley Scott. Twórcy rozwinęli pomysły i niewiadome wynikające z tego filmu. Ukuliśmy nową mitologię, na której opiera się cała historia. Oczywiście nawiązania do „Obcego” są jasne, ale to prawdziwie oryginalna opowieść i nowe ogniwo gatunku science fiction – zapewnia reżyser.