Tomek Miłkowski, rysownik komiksów w magazynie „Świat Fantazji” prawdopodobnie straci pracę. Kiedy pogrąża się w ponurych myślach, jego wzrok pada na półkę z książkami, wśród których znajduje opowieść o Panu Kleksie. Tomek, zainspirowany książką, zaczyna szkicować nową historię przygód Ambrożego Kleksa. Wkraczamy w animowany świat profesora i jego przyjaciół, zmagających się z intrygami złowieszczego Alojzego Bąbla.